Dani Pedrosa le ha ganado un espectacular mano a mano a Jorge Lorenzo, una trabajada victoria que le hace recortar la distancia que le separa del mallorquín en la clasificación general y ya se sitúa a tan solo 13 puntos dejando el Campeonato completamente abierto. Nada más comenzar la carrera Lorenzo se ha situado en cabeza pero Dani Pedrosa no estaba dispuesto a dejarle escapar y se ha mantenido a rueda del piloto de Yamaha hasta el ecuador de la carrera cuando el de Honda ha decidio tomar las riendas de la carrera. Lorenzo ha aprovechado para descansar y mantenerse a rueda de Pedrosa hasta comenzar la intensa lucha de adelantamientos a tres vueltas del final.
Finalmente Dani Pedrosa ha cruzado la línea de meta por delante del mallorquín, "cada uno tenia sus puntos fuertes y sus puntos débiles. He intentado tapar huecos en las últimas vueltas. Ha sido una carrera increíble". Lorenzo ha compartido la opinión de Pedrosa respecto a la espectacular lucha ofrecida por los dos, "ha sido una carrera para recordar, lo hemos dado todo los dos. Se ha merecido la victoria porque ha tenido mejor estrategia al final. Lo bueno es que no nos hayamos caído los dos".
Cal Crutchlow ha finalizado el fantástico fin de semana con una tercera posición y ha subido al podio por primera vez esta temporada. A las puertas del podio se ha quedado su compañero de equipo Andrea Dovizioso que ha cruzado la bandera de cuadros por delante de Stefan Bradl, Álvaro Bautista y Valentino Rossi.
La primera CRT del Gran Premio de la República Checa ha sido la de Randy de Puniet que ha entrado en octava posición por delante de la Ducati satélite de Karel Abraham, que corría en casa. Aleix Espargaró ha sido el encargado de cerrar el top 10 en Brno por delante de Toni Elías que ha sido undécimo con la Ducati Pramac.
A quién no le abandona la racha negativa es a Ben Spies que después de sufrir algun problema mecánico al principio de la carrera y empezar a remontar las posiciones perdidas, se ha ido al suelo cuando corría en la octava posición.
| Piloto | Equipo | Marca | Tiempo | GAP | |
| 1 | Dani PEDROSA | Repsol Honda Team | HONDA | 42'51.570 | |
| 2 | Jorge LORENZO | Yamaha Factory Racing | YAMAHA | 42'51.748 | 0.178 |
| 3 | Cal CRUTCHLOW | Monster Yamaha Tech 3 | YAMAHA | 43'03.913 | 12.343 |
| 4 | Andrea DOVIZIOSO | Monster Yamaha Tech 3 | YAMAHA | 43'10.161 | 18.591 |
| 5 | Stefan BRADL | LCR Honda MotoGP | HONDA | 43'17.152 | 25.582 |
| 6 | Alvaro BAUTISTA | San Carlo Honda Gresini | HONDA | 43'21.021 | 29.451 |
| 7 | Valentino ROSSI | Ducati Team | DUCATI | 43'26.084 | 34.514 |
| 8 | Randy DE PUNIET | Power Electronics Aspar | ART | 43'55.855 | 1'04.285 |
| 9 | Karel ABRAHAM | Cardion AB Motoracing | DUCATI | 43'59.848 | 1'08.278 |
| 10 | Aleix ESPARGARO | Power Electronics Aspar | ART | 44'01.542 | 1'09.972 |
| 11 | Toni ELIAS | Pramac Racing Team | DUCATI | 44'01.573 | 1'10.003 |
| 12 | Yonny HERNANDEZ | Avintia Blusens | BQR | 44'15.610 | 1'24.040 |
| 13 | Colin EDWARDS | NGM Mobile Forward Racing | SUTER | 44'19.468 | 1'27.898 |
| 14 | Michele PIRRO | San Carlo Honda Gresini | FTR | 44'27.735 | 1'36.165 |
| 15 | James ELLISON | Paul Bird Motorsport | ART | 44'32.135 | 1'40.565 |
| 16 | Mattia PASINI | Speed Master | ART | 44'32.796 | 1'41.226 |
| 17 | Danilo PETRUCCI | Came IodaRacing Project | IODA | 42'59.186 | 1 lap |
| No clasificados | |||||
| Ivan SILVA | Avintia Blusens | BQR | 18'19.728 | 13 laps | |
| Ben SPIES | Yamaha Factory Racing | YAMAHA | 15'53.910 | 14 laps | |